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microRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體構(gòu)建服務(wù)
microRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體構(gòu)建服務(wù)
 
MicroRNA簡(jiǎn)介:
  MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)生的、長(zhǎng)度約20-24個(gè)核苷酸的小RNA,是發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過(guò)Dicer酶加工后生成。其在細(xì)胞內(nèi)具有多種重要的調(diào)節(jié)作用。每個(gè)miRNA可以有多個(gè)靶基因,而幾個(gè)miRNAs也可以調(diào)節(jié)同一個(gè)基因。這種復(fù)雜的調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)既可以通過(guò)一個(gè)miRNA來(lái)調(diào)控多個(gè)基因的表達(dá),也可以通過(guò)幾個(gè)miRNAs的組合來(lái)精細(xì)調(diào)控某個(gè)基因的表達(dá)。據(jù)推測(cè),miRNA調(diào)節(jié)著人類三分之一的基因。
MicroRNA有以下幾種形式:
    pre-miRNA
    約70bp含microRNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)的pre-miRNA。
    primiRNA
    天然primiRNA :從染色體基因文庫(kù)中調(diào)取300bp-1000bp完整的microRNA基因,克隆到質(zhì)粒載體(普通載體或病毒載體),以強(qiáng)大的CMV啟動(dòng)子操 縱該300bp-1000bp microRNA。
    人工primiRNA 選擇一個(gè)完整的microRNA基因,克隆到質(zhì)粒載體(普通載體或病毒載體)。以人工合成的約70bp含miRNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)的目標(biāo)pre-RNA替代原pre-RNA,并以pol Ⅱ/pol III 啟動(dòng)子操縱該microRNA結(jié)構(gòu)單元。
 
  pre-miRNA是最早采用的microRNA,擁有大量的成功報(bào)道。化學(xué)合成的pre-miRNA制備快捷,可以標(biāo)記熒光等追蹤。缺點(diǎn)是制備的RNA穩(wěn)定性較差,而且,由于制備的microRNA較長(zhǎng),合成時(shí)RNA的錯(cuò)誤難以避免(當(dāng)合成RNA超過(guò)60bp時(shí),出現(xiàn)一個(gè)堿基錯(cuò)誤率約30%),轉(zhuǎn)錄制備的pre-miRNA穩(wěn)定性較好,但無(wú)flank結(jié)構(gòu),很少使用。質(zhì)粒載體形式的pre-miRNA也因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)microRNA的flank對(duì)于microRNA功能和測(cè)定非常重要,現(xiàn)已逐漸被pri-miRNA取代。人工pri-miRNA效果較pre-miRNA好,也有足夠多的成功使用的經(jīng)驗(yàn)報(bào)道,但這種人工microRNA采用固定的mir155 flank,制備的microRNA功能不及天然原始microRNA,故也逐漸較少使用。原始天然pri-miRNA克隆自天然文庫(kù)的microRNA由于保留了每個(gè)microRNA獨(dú)自的原始天然雙臂結(jié)構(gòu),效果更好,是近來(lái)被首選方法。
 
 
 
 
MicroRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體特點(diǎn):
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
我們采用美國(guó)進(jìn)口的第三代microRNA過(guò)表達(dá)慢病毒表達(dá)載體,有HIV來(lái)源的和FIV來(lái)源兩種,能夠高效表達(dá)出原始天然pri-miRNA和MicroRNA基因簇,詳情請(qǐng)參見(jiàn)慢病毒載體信息,我們的microRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體具有以下特點(diǎn):
 
 
 
 
一、CMV啟動(dòng)子高效表達(dá)出原始天然pri-miRNA,我們從人、大鼠、小鼠基因組或腫瘤組織中克隆出pri-miRNA,完全忠實(shí)細(xì)胞內(nèi)的天然結(jié)構(gòu),具有更高的效率,更重要的是,它能在細(xì)胞內(nèi)準(zhǔn)確無(wú)誤地表達(dá)出天然microRNA。
載體表達(dá)出的pri-miRNA結(jié)構(gòu):
 
 
二、著成千上萬(wàn)條miRNA被鑒定出來(lái),用microRNA干預(yù)基因功能或藥物篩選的需求越來(lái)越多。由于microRNA慢病毒載體能夠被包裝成microRNA慢病毒顆粒,用于感染分裂期和非分裂期細(xì)胞,如原代細(xì)胞、難于轉(zhuǎn)染的細(xì)胞或干細(xì)胞等,使其成為活體研究甚至基因治療的里程碑。
 
三、microRNA慢病毒載體經(jīng)可包裝成慢病毒顆粒,microRNA慢病毒感染過(guò)的細(xì)胞能夠長(zhǎng)久表達(dá)miRNA,且這種表達(dá)具有可遺傳性,與化學(xué)合成的miRNA或表達(dá)miRNA質(zhì)粒實(shí)現(xiàn)的瞬時(shí)表達(dá)相比,這種特點(diǎn)與天然的microRNA機(jī)制更相似。
 
四、copGFP與miRNA前體共同表達(dá),可用于陽(yáng)性細(xì)胞流式篩選與鑒定。
 
五、構(gòu)建的載體可以含有完整MiRNA基因簇,可用于高通量表型篩選研究。
 
六、含有多種優(yōu)勢(shì)元件:
       3 ΔLTR (ΔU3)
       3’ LTR區(qū)域刪除了U3,使其不再有啟動(dòng)/增強(qiáng)活性,成為自滅活(self-inactivating, SIN) 載體,即整合到細(xì)胞基因組后,不會(huì)產(chǎn)生新的子代病毒,也降低了對(duì)周圍基因的意外激活。
       copGFP
綠色熒光報(bào)告基因,與常用的EGFP類似,但熒光更亮。
       Zeo抗性基因
陽(yáng)性細(xì)胞篩選。
       pUC起始點(diǎn)
使質(zhì)粒在 E.coli 中高密度拷貝并且保持穩(wěn)定。
       RSV/5’LTR RSV雜交啟動(dòng)子-R/U5’長(zhǎng)末端重復(fù)序列
讓全長(zhǎng)病毒在293前體細(xì)胞中高水平包裝和轉(zhuǎn)錄表達(dá)。
       CMV/5’LTR CMV雜交型啟動(dòng)子-R/U5長(zhǎng)末端重復(fù)序列)
使慢病毒載體保持高水平轉(zhuǎn)錄和高效轉(zhuǎn)錄出含病毒包裝必需功能元件(如Psi, RRE, and cPPT等)的轉(zhuǎn)錄本,當(dāng)用病毒包裝細(xì)胞系(如HEK 293細(xì)胞)包裝病毒時(shí)也能表達(dá)病毒衣殼蛋白。
       SV40起始點(diǎn)
使質(zhì)粒在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中穩(wěn)定復(fù)制。
       SV40多聚A加尾信號(hào)
強(qiáng)制轉(zhuǎn)錄終止子,有效終止轉(zhuǎn)錄或者終止共轉(zhuǎn)錄過(guò)程,維持穩(wěn)定態(tài)mRNA高水平表達(dá)。
       LCS無(wú)連接酶克隆位點(diǎn)
不依賴多克隆位點(diǎn),能將各種目的microRNA插入載體,不需要DNA鏈接酶,較常規(guī)方法可靠。
       WPRE元件
增強(qiáng)CMV啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的穩(wěn)定性。
 
說(shuō)明:每種載體用的優(yōu)勢(shì)元件均有所不同 
  
客制化服務(wù)方案:
             
  目前我們能夠?yàn)榭蛻籼峁┌╩iRNA表達(dá)譜分析、慢病毒載體構(gòu)建、測(cè)序、慢病毒生產(chǎn)等一站式服務(wù)。我們的服務(wù)將為客戶最大限度地提高效率和節(jié)省時(shí)間。另外,我們的技術(shù)專家將為您的實(shí)驗(yàn)提供全程支持,請(qǐng)Email至[email protected]。
  同時(shí),我們?yōu)榭蛻籼峁﹎iRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體構(gòu)建服務(wù)的個(gè)性化定制服務(wù)方案,包括根據(jù)miRNA特征、目的細(xì)胞特征與客戶需求,我們會(huì)為客戶選擇最合適的慢病毒載體、啟動(dòng)子、熒光標(biāo)記或選擇性抗性標(biāo)記,插入pri-miRNA或miRNA基因簇使其過(guò)表達(dá),客戶也可以根據(jù)我們的載體信息自行挑選;同時(shí)又可以根據(jù)客戶的需要,可在重組慢病毒載體中加入各種報(bào)告基因或標(biāo)簽(或進(jìn)行改造),從而構(gòu)建miRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體。
  我們有標(biāo)準(zhǔn)的客制化服務(wù)流程,同時(shí)我們也會(huì)根據(jù)客戶需求,為每個(gè)客戶度身定制各種MicroRNA慢病毒載體構(gòu)建服務(wù)方案。如有需要,歡迎致電021-34512321咨詢。
 
 
標(biāo)準(zhǔn)客制化服務(wù)流程:
 
microRNA過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建服務(wù)列表:
 
  我們可以根據(jù)客戶需求構(gòu)建各種濃度的超純純化miRNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體,能被包裝成miRNA過(guò)表達(dá)慢病毒顆粒;無(wú)內(nèi)源性多聚A信號(hào);對(duì)靶細(xì)胞無(wú)毒;從5 to 3 LTR序列大小大于8kb;可直接轉(zhuǎn)染細(xì)胞,用于瞬時(shí)轉(zhuǎn)染;也可以包裝成病毒顆粒,用于穩(wěn)定長(zhǎng)效表達(dá)。
 
超純純化標(biāo)準(zhǔn):
                   內(nèi)毒素<10EU/mg質(zhì)粒DNA
                   RNA<0.2ug/mg
                   基因組DNA<2ug/mg
                   蛋白<3ug/mg 
 
      編號(hào)
cDNA過(guò)表達(dá)慢病毒載體構(gòu)建
標(biāo)準(zhǔn)
工作日
C200001
10 μg
超純純化
10
C200002
20 μg
超純純化
10
C200003
40 μg
超純純化
10
 
 
 
 
 
 
 
 
表達(dá)出的MicroRNA是內(nèi)源性MicroRNA的幾倍:
  用HIV來(lái)源的慢病毒載體構(gòu)建的MicroRNA Lenti-miR載體包裝成病毒顆粒之后,感染HEK293細(xì)胞,表達(dá)的MicroRNA用qPCR檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)用我們的過(guò)表達(dá)載體表達(dá)出MicroRNA是內(nèi)源性MicroRNA的幾倍以上。
 
  
共表達(dá)microRNA基因簇:
  microRNA(miRNA)基因簇是一類miRNA基因在染色體上成簇排列形成的基因群. 在動(dòng)植物基因組中,已發(fā)現(xiàn)存在大量簇生排列的miRNA基因。然而這種簇生排列方式所具有的功能意義尚不完全清楚. miRNA基因簇常位于一個(gè)多順?lè)醋觾?nèi), 通過(guò)共表達(dá)在胚胎發(fā)育、細(xì)胞周期、腫瘤發(fā)生、細(xì)胞分化等諸多方面發(fā)揮協(xié)同調(diào)控的功能。
  詳細(xì)的構(gòu)建服務(wù)流程及其他信息請(qǐng)見(jiàn)上述microRNA慢病毒載體構(gòu)建服務(wù)內(nèi)容。
 
腫瘤和干細(xì)胞MicroRNA基因簇:
 
 
乳腺癌腫瘤干細(xì)胞MicroRNA基因簇:
 
 
 
成功案例:
 
miR-10b construct cloned using Clone-it microRNA Cloning System was transiently transfected into 293 cells with the indicated amount of plasmid DNA.  Mature miR-10b was measured using qPCR
  
 
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